Anomalith mergulha o jogador numa versão estranha do Japão, marcada por espaços liminares e pela estética retrô da era Showa. Você assume o papel de uma garota que parte em busca de uma amiga desaparecida e atravessa um mundo cheio de anomalias, onde a atmosfera densa e a sensação constante de inquietação definem cada local.
O jogo combina sobrevivência, combate em terceira pessoa e elementos de RPG: é preciso explorar ambientes, enfrentar criaturas anômalas em confrontos diretos e progredir para desvendar o mistério por trás das ocorrências. A experiência alterna entre exploração tensa e confrontos, exigindo observação, adaptação e uso de habilidades disponíveis para avançar.